なにをやっているのか
つるおか献便ルーム（山形県鶴岡市）。2025年に開設した日本初の献便施設です
FMT治験薬製造センター（神奈川県川崎市キングスカイフロント）
健康な人の便に含まれる腸内細菌を、患者さんの治療に使う。メタジェンセラピューティクスは、この「腸内細菌叢移植（FMT）」を社会に届けるスタートアップです。2020年に順天堂大学・慶應義塾大学・東京科学大学発のベンチャーとして創業し、本社を山形県鶴岡市に置いています。
■ 医療サービス事業：FMTを医療技術として届ける
内視鏡で腸内細菌を届けるFMTを、医療機関と連携して社会実装しています。潰瘍性大腸炎を対象とした腸内細菌叢移植の試験では、順天堂大学と取り組んだ先進医療Bで寛解導入率45.9％という結果を得ました。消化管がん（免疫チェックポイント阻害薬との併用）とパーキンソン病でも臨床研究を進めています。
■ 創薬事業：FMTを飲み薬にする
FMTを経口カプセルで届ける医薬品を開発しています。2026年、潰瘍性大腸炎の患者さんを対象とした治験を日本と米国で開始しました。日本で初めて実施されるFMT医薬品の治験です。
■ 便を集め、薬にするまでを自分たちの手で
FMTの原材料は、健康なドナーさんから提供いただく便です。ドナーの募集・検査から献便、製造までの道のりを自社で築いてきました。
・日本初の献便施設「つるおか献便ルーム」（山形県鶴岡市、2025年開設）
・FMT治験薬製造センター（神奈川県川崎市キングスカイフロント、2025年開設）
・腸内細菌ドナー支援アプリ「ちょうむすび」（レッドドット・デザイン賞 Best of the Best、グッドデザイン賞を受賞）
助成金を含む累計調達額は71億円を超えました（2026年9月時点）。
なぜやるのか
ひとりの健康が誰かの健康につながる「ヘルスシェア」のビジョンマップ
■ 患者さんの願いを、叶え続けるために
私たちのパーパスは「マイクロバイオームサイエンスで、患者さんの願いを叶え続ける」です。「救う」ではなく「叶え続ける」としたのは、患者さんに寄り添い、歩み続ける決意を表すためです。
■ 腸内細菌治療を患者さんに届けたい
私たちの腸には約40兆個の細菌が暮らしています。腸内細菌叢の乱れは、消化器の病気だけでなく、がんや神経の病気との関わりも研究で明らかになりつつあります。米国や豪州では便由来の医薬品がすでに承認されていますが、日本でFMTを受けられる患者さんはまだ限られています。
研究で効果が見えても、それだけでは治療は届きません。ドナーの確保、検査、製造、品質管理、薬事、医療現場での運用までがそろって、はじめて続けられる医療になります。だから私たちは、研究で終わらせず、患者さんに届く仕組みごとつくる道を選びました。サイエンスで妥協せず、薬事などの社会のルールからも逃げない。これまでの創薬の正解を疑い、ゼロから新しい治療法をつくっています。
■ 「ヘルスシェア」という新しい健康の循環
献血や骨髄バンクのように、健康な人の腸内細菌が誰かの治療になる。本社のある鶴岡では、地域の皆さんや企業と一緒に、献便を新しい社会貢献のかたちとして育てています。献便で集まった腸内細菌やデータは腸内細菌バンクに蓄積され、創薬や医療サービスの開発に活かされます。ひとりの健康が誰かの健康につながる「ヘルスシェア」の社会が、私たちの描く未来です。
どうやっているのか
2025年春の全社合宿
■ 5つのバリュー
・Patient-centric：患者さんに寄り添い、治療を最短距離で届けることを目指す
・Impact Oriented：人類が実感できるインパクトを産み出し続ける
・Scientific Integrity：科学の力を信じ、科学のレベルを高く維持する
・Talent Collective：スペシャリストの「銀河集団」としてゴールを目指す
・Being Likable：オープンで誠実なコミュニケーションができる信頼できる「いい奴」でいる
■ 専門家が分野を越えて、ひとつのチームに
社員は約60名です。腸内細菌の研究者、医師、臨床開発、CMC（製造・品質）、バイオインフォマティクス、事業開発、コーポレートの専門家が、事業を前に進めています。前職はアカデミア、製薬・食品などの事業会社、メディア、スタートアップとさまざまです。順天堂大学、慶應義塾大学、国立がん研究センターをはじめとする大学・医療機関や企業とも連携しています。
■ 鶴岡・東京・川崎、そして全国から
本社とつるおか献便ルームは山形県鶴岡市、東京事務所は大手町、FMT治験薬製造センターは川崎市にあります。北海道・大阪・福岡などからフルリモートで働くメンバーもいます。職種に応じて裁量労働制とフレックスタイム制を採り、リモートと出社を組み合わせて働いています。全社合宿など、拠点を越えて顔を合わせる機会もつくっています。
「この会社がある前と後で、世界は大きく変わった」。そう言われる会社を、一緒につくりませんか。
